Frei og Kristiansund utførte sin første kartlegging av naturtyper i 2003. Kartleggingen foretas etter metode i: Håndbok 13, 2. utgave 2006, oppdatert 2007 utarbeidet av Direktoratet for naturforvaltning. I tillegg har tidligere Frei kommune kartlagt leveområder for dyr og fugler (viltområder) i 2007, som et ledd i biologisk mangfoldkartleggingen.
Biologisk mangfold er et samlebegrep for all verdens plante- og dyreliv, og begrepet kan forklares som den uendelige variasjonen av naturtyper, planter, dyr og andre organismer.
Den mest sentrale loven i dette arbeidet er: Lov om naturmangfold av 2009. Loven regulerer bl a forvaltning av arter, områdevern og utvalgte naturtyper.
Utfordringen i Kristiansund er å skape økt bevissthet omkring vår naturarv for å kunne forstå viktigheten av naturens betydning. På denne måten kan vi bedre ta vår del av ansvaret i å sikre det biologiske mangfoldet slik loven om naturmangfold krever. Dette krever både kunnskap og kjennskap til vår natur. En natur som vi og våre etterkommere til syvende og sist er så avhengig av.
Det er først og fremst gjennom kommunens arealforvaltning den store utfordringen ligger i å sikre at kommende generasjoner skal få ta del i de samme naturopplevelsene som oss. Vi må da først vite hvor våre verdifulle naturområder ligger. Kartleggingen i 2011 vil gi oss en bedre kunnskap om dette. Kartleggingen vil bygge på kartleggingen i 2002 – 2003. I tillegg skal kartleggingen i 2011 innehold kartlegging av tidligere kartlagte verdifulle områder som er planlagt nedbygd, eller vil få negative påvirkninger pga menneskelig aktivitet.
Ødeleggelse, nedbygging av leveområdene til våre sjeldne planter, dyr og fugler er den største trusselen i Kristiansund. Flere av disse områdene er allerede nedbygd – ødelagt eller er i vår arealplan planlagt nedbygd eller vil påvirke leveområdene. På sikt vet vi ikke konsekvensene for våre mest utsatte arter, og hva summen av påvirkningen ødeleggelsene vil bli i enn større sammenheng.
Det er Fylkesmannen som har både prosjektansvar og økonomiske ansvar. Kartleggingen utføres av samme firmaet som i 2002: Miljøfaglig Utredning fra Tingvoll.